cclinksモジュールを２個インストールしようとしたところエラーとなり、インストール出来ませんでした。
２個目は"cclinks0"としたところ「モジュールは既に存在します」のメッセージでした。このCCLinkを２個以上を設置する方法はありますか？宜しくお願いいたします。

残念ながら、CCLinksについては複数設置はサポートしていません。
プログラムを改変すれば別ですが、そういう予定もありません。



余談ですが、XOOPSのモジュールでは複数設置対応のものの方が少ないと思いますし、可能なものはほぼ必ず「複数設置可能」という表現とそのやり方が説明されていると思います。